A Secretaria Municipal da Saúde (SMS) trabalha com a missão de formular e gerir políticas públicas para atender as necessidades de saúde da população no município de Fortaleza, assegurando os princípios do Sistema Único de Saúde (SUS), com uma visão de ser reconhecida pelo compromisso na busca da excelência na atenção à saúde e com valores como: competência, responsabilização, cooperação, transparência e humanização. 

A Rede Municipal de Saúde de Fortaleza oferece atendimentos na Atenção Primária, Secundária e Terciária garantido, por meio dos postos de saúde, das unidades de pronto atendimento (UPAs), dos hospitais, dos centros de atenção psicossocial (Caps) e dos centros de especialidades odontológicas (CEOs). Além dessas unidades, a SMS oferece também o Serviço de Atendimento Móvel de Urgência (Samu), as farmácias populares e uma rede conveniada composta por clínicas e hospitais públicos, privados e filantrópicos que prestam serviços de consultas, exames e internações. Também estão sob a responsabilidade da SMS a Vigilância Epidemiológica (inclusive imunização de animais contra calazar e raiva), Sanitária, Ambiental e Riscos Biológicos.

A Secretaria Municipal da Educação (SME) administra o Sistema Municipal de Educação, coordenando a Política Municipal de Educação, mediante a formulação de políticas públicas e diretrizes gerais, visando à otimização e à garantia de padrões de qualidade do modelo educacional e ao consequente aumento dos índices de escolaridade.

Em julho de 2007, a Lei Complementar Nº 0039, criou a SME por meio da reestruturação da Secretaria Municipal de Educação e Assistência Social (Sedas), separando as Pastas da Assistência e Educação. Além da SME, foi criada a Secretaria Municipal de Assistência Social (Semas). A separação entre Assistência e Educação proporciona um avanço e a autonomia na elaboração e no desenvolvimento de projetos e ações.

A Secretaria de Urbanismo e Meio Ambiente do Município de Fortaleza (Seuma) tem como missão planejar e controlar o ambiente natural e o ambiente construído da Capital.

A importância da cidade na contemporaneidade e os desafios a serem vencidos para torná-la um lugar bom para viver faz com que o século XXI já se consolide como o “século das cidades”. Isto significa ter um lugar para morar em condições adequadas, ter um trabalho digno para suprir as demandas de consumo do cotidiano e dispor de espaços de lazer entretenimento para estreitar seus laços sociais e estar de bem com a vida. Tudo isto interligado por uma rede de acessibilidade que reduza tempo e custo nos deslocamentos. Alcançar tais requisitos depende de Planejamento e Controle do Ambiente Natural e do Ambiente Construído.

A Secretaria dos Direitos Humanos e Desenvolvimento Social de Fortaleza (SDHDS) foi criada em 2017, com a fusão das antigas Secretarias de Trabalho, Desenvolvimento Social e Combate à Fome (Setra) e de Cidadania e Direitos Humanos (CSDH). Tem o objetivo de promover, garantir, valorizar e difundir os direitos humanos e sociais da população. É responsável por ações, equipamentos, eventos e conselhos voltados para executar políticas públicas para idosos, população LGBT, negros, mulheres, pessoas com deficiência, segurança alimentar, assistência social, com destaque para a população em situação de rua.

Criada em outubro de 2005, a Secretaria de Turismo de Fortaleza tem como objetivo planejar, promover e desenvolver a atividade turística no Município, bem como incrementar as potencialidades socioeconômicas e de lazer.

A visão do órgão é tornar Fortaleza referência nacional e internacional na atividade turística, sendo o turismo a principal fonte de renda da Capital.

A Secretaria Municipal de Segurança Cidadã (Sesec) executa, por meio de órgãos vinculados, as políticas públicas de interesse da Pasta, coordenando e gerenciando a integração com as políticas sociais do Município que, direta ou indiretamente, interfiram nos assuntos de segurança cidadã da cidade.

Também tem o papel de estabelecer relação com os órgãos de segurança estaduais e federais, visando uma ação unificada na Capital, inclusive com planejamento e integração das comunicações. O objetivo da Sesec é estabelecer e implementar políticas públicas, diretrizes e programas voltados a proteção, prevenção e participação cidadã na gestão de segurança e Defesa civil em Fortaleza.

A Secretaria é composta de coordenadorias que dialogam entre si e com outros atores da esfera pública e da sociedade em busca de ferramentas de enfrentamento da violência.